derfinder

El objetivo de mi Ph.D. con Jeff Leek y Andrew Jaffe en JHBSPH fue desarrollar métodos estadísticos y software que permitan a los investigadores diferenciar las fuentes de variación observadas en RNA-seq mientras se minimiza la dependencia de la anotación conocida. Esto permite a los investigadores corregir la variación tecnológica y estudiar la variación biológica que impulsa su fenotipo de interés. Este trabajo condujo al desarrollo de los paquetes de bioconductores derfinder y regionReport. Luego aplicamos estos métodos para mejorar nuestra comprensión de los trastornos neuropsiquiátricos utilizando la colección de cerebros humanos del Lieber Institute for Brain Development.