Overview
Code of Conduct
Course Schedule
External links
Course Prerequisites
Course Evaluation
R session information
License
1
Introducción a R y RStudio
1.1
R
1.2
GitHub
1.3
RStudio
1.4
Material del curso
1.5
Actividad postcards (opcional)
2
Introducción a Bioconductor
2.1
Encontrando paquetes de Bioconductor
2.2
Estructura de un paquete de BioC
2.3
Las dos ramas de Bioconductor: release y devel
2.4
Cursos y eventos
2.5
Comunidad
2.6
Ejercicio grupal
3
Objetos de Bioconductor para datos de expresión
3.1
SummarizedExperiment
3.2
Ejercicio
3.3
iSEE
3.4
Ejercicio con spatialLIBD
3.5
Comunidad
4
Datos de RNA-seq a través de recount3
4.1
Procesar datos crudos (FASTQ) con SPEAQeasy
4.2
Proyectos recount
4.3
Usar recount3
4.4
Ejercicio
4.5
Comunidad
5
Modelos estadísticos
5.1
ExploreModelMatrix
5.1.1
Ejemplo 1
5.1.2
Ejemplo 2
5.1.3
Ejemplo 3
5.1.4
Ejercicio
5.1.5
Para aprender más
5.2
Datos de SRP045638
5.3
Normalización de datos
5.4
Expresión diferencial
5.5
Visualizando genes DE
5.6
Ejercicio
5.7
Comunidad
5.8
Ejercicio: respuesta
5.9
Sobre
centering
y
scaling
en heatmaps
5.10
Específicaciones del proyecto
6
smokingMouse
7
Revisión
7.1
Ejercicio en equipo
7.2
Respuestas
8
R/Bioconductor-powered Team Data Science
9
spatialLIBD
10
Comunidad
10.1
De alumnos LCG 2021
10.2
De ustedes
Intro RNA-seq LCG-UNAM 2023
6
smokingMouse
Presentación
Código:
LieberInstitute/smokingMouse_Indirects
Notas públicas de Daianna:
Notion
.